Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r232A2RTT5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r232A2RTT5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 346.4 ms