Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms