Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TBC1D21-202ENST00000535547 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms