Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC025572.1-201ENST00000472243 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC027313.1-201ENST00000509159 1666 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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