Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CRABP1P29762 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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CRABP1P29762 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CRABP1P29762 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CRABP1P29762 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CRABP1P29762 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CRABP1P29762 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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