Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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HOXD10P28358 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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