Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms