Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AP006222.1-201ENST00000442116 1292 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYGBP11216 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms