Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atxn3Q9CVD2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atxn3Q9CVD2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atxn3Q9CVD2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atxn3Q9CVD2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn3Q9CVD2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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