Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Pkn3Q8K045 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkn3Q8K045 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkn3Q8K045 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkn3Q8K045 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkn3Q8K045 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkn3Q8K045 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkn3Q8K045 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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