Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP46P62068 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP46P62068 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP46P62068 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP46P62068 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP46P62068 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP46P62068 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP46P62068 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP46P62068 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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