Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms