Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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