Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms