Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms