Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms