Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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