Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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