Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms