Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL14-201ENST00000320767 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS31P5-202ENST00000423686 920 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01715-202ENST00000427804 688 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD1-AS1-206ENST00000449197 523 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093714.1-201ENST00000470532 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02116-201ENST00000509455 493 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073651.1-201ENST00000544015 465 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005954.2-201ENST00000586503 556 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms