Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST2Q8NFU1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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