Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Hoxc12Q8K5B8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Hoxc12Q8K5B8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Hoxc12Q8K5B8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Hoxc12Q8K5B8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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