Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms