Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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