Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms