Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CA4P22748 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA4P22748 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA4P22748 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA4P22748 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA4P22748 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CA4P22748 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CA4P22748 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CA4P22748 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms