Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XBP1P17861 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms