Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms