Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591686.1-201ENST00000421878 766 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450309.1-201ENST00000423792 656 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf74-203ENST00000432605 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097534.2-204ENST00000608892 284 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP4-211ENST00000628861 433 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUN3-202ENST00000395572 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512310.2-201ENST00000547175 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02297-201ENST00000548050 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms