Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms