Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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