Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms