Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDGFDQ9GZP0 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDGFDQ9GZP0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDGFDQ9GZP0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDGFDQ9GZP0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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