Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms