Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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