Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms