Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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