Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l3Q9WV92 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41l3Q9WV92 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41l3Q9WV92 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms