Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Higd1aQ9JLR9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms