Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog8Q9JJA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog8Q9JJA2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog8Q9JJA2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms