Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrotQ9DC50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrotQ9DC50 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrotQ9DC50 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms