Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DAA3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9DAA3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9DAA3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9DAA3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms