Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6v1e2Q9D593 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v1e2Q9D593 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp6v1e2Q9D593 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v1e2Q9D593 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v1e2Q9D593 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v1e2Q9D593 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v1e2Q9D593 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v1e2Q9D593 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms