Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Malsu1Q9CWV0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms