Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpbpbQ9CQC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 705.4 ms