Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim12aQ99PQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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