Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSL1Q96IY1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms