Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atl3Q91YH5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atl3Q91YH5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms