Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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