Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH3Q8TE77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH3Q8TE77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms